Co je spike protein?
Spike protein je typ proteinu, který se nachází v některých virech. Je také známý jako peplomerový protein, který tvoří velkou strukturu známou jako hrot nebo peplomer vyčnívající z povrchu obaleného viru. Spike proteiny využívají především viry, které infikují eukaryotické buňky, například buňky rostlin a živočichů.
Co to je spike protein?
Z čeho jsou proteiny složeny
Spike proteiny jsou často složeny z glykoproteinů a mají několik funkcí, včetně přichycení k hostitelským buňkám a vazby na další virové složky. Mohou také pomáhat regulovat vstup do buněk a zabraňovat předčasnému splynutí s hostitelskými buňkami. Spike proteiny se u různých typů virů výrazně liší.
Dále se mohou například skládat pouze z jednoho typu glykoproteinu nebo mohou obsahovat více glykoproteinů uspořádaných na svém povrchu různými způsoby.
Spike proteiny se vyskytují u všech typů obalených virů, včetně herpesvirů, jako je herpes simplex virus 1 (HSV-1) a herpes simplex virus 2 (HSV-2), které způsobují opary, resp. genitální herpes poxvirů, jako je virus vakcín. Dále pak u retrovirů, jako je HIV, koronavirů, jako je SARS-CoV, paramyxovirů, jako je virus spalniček, bunyavirů, jako je virus spalniček, a dalších virů, jako je například virus spalniček a dalších.
Funkce spike proteinu
- Spike protein má dvě funkce - připevnění a průnik. Proteiny hrotu HIV se nazývají gp120 a gp41. HIV-1 gp120 se váže na CD4, receptor nacházející se na povrchu T-lymfocytů (CD4+ lymfocytů). To umožňuje viru navázat se na tyto buňky, které jsou následně infikovány fúzí na plazmatické membráně.
- Virus HIV-1 gp41 funguje jako kotva, když se vkládá do membrány hostitelské buňky. To je nutné pro jeho vstup do buňky, protože ke splynutí s membránou vyžaduje specifické pH.
- Protein spike je důležitou součástí kapsidy, která se skládá z mnoha kopií jednoho nebo více kapsidových proteinů. Kapsida uzavírá virový genom a napomáhá jeho sestavení v buňce.
- Po sestavení chrání genom před degradací nukleázami a funguje také jako receptor pro připojení k hostitelským buňkám.
Pro Dudlu napsala: Marcela Kalousová | Edit: Andrea B.